34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1998 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1231    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  37.67 
 
 
648 aa  342  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  32.78 
 
 
631 aa  334  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  33.83 
 
 
630 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  36.19 
 
 
642 aa  324  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  33.74 
 
 
618 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  33.33 
 
 
618 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  33.16 
 
 
617 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  33.33 
 
 
617 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  33.16 
 
 
617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  32.99 
 
 
617 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  32.99 
 
 
620 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  32.78 
 
 
620 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  31.83 
 
 
617 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  30.96 
 
 
617 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  34.39 
 
 
629 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  31.64 
 
 
617 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  30.74 
 
 
622 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  35.13 
 
 
625 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  31.94 
 
 
619 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  33.12 
 
 
645 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  32.16 
 
 
664 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  32.59 
 
 
668 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  32.59 
 
 
665 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  29.86 
 
 
678 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  25.93 
 
 
718 aa  191  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  25.3 
 
 
720 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  32.05 
 
 
670 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  28.27 
 
 
618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  26.36 
 
 
615 aa  147  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  27.11 
 
 
636 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  24.03 
 
 
653 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  25.12 
 
 
598 aa  47.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  23.61 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>