More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2014 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
325 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.11 
 
 
324 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.62 
 
 
325 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.23 
 
 
326 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  77.47 
 
 
326 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  75.31 
 
 
333 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75 
 
 
326 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  64.09 
 
 
324 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.56 
 
 
343 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.43 
 
 
344 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  59.49 
 
 
343 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.82 
 
 
339 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 
339 aa  371  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.43 
 
 
332 aa  305  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
321 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  45.65 
 
 
321 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
321 aa  294  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 
321 aa  292  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
321 aa  291  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  44.14 
 
 
321 aa  289  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
321 aa  289  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
321 aa  288  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  46.75 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  46.44 
 
 
321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
316 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
306 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 
316 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 
316 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
331 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  39.75 
 
 
316 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  39.13 
 
 
316 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
321 aa  256  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 
322 aa  255  7e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 
312 aa  255  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  39.13 
 
 
316 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.13 
 
 
316 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
319 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.18 
 
 
320 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 
318 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
319 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  40.37 
 
 
318 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 
318 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1749  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.12 
 
 
319 aa  246  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.258906  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
334 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.67 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
322 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
318 aa  242  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
309 aa  242  6e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.93 
 
 
317 aa  242  7e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000495045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
320 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
320 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  38.15 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
321 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
318 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
321 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
322 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
328 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  38.94 
 
 
319 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
336 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
350 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.734865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  38.51 
 
 
318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.51 
 
 
318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
321 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.2 
 
 
318 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  40.43 
 
 
315 aa  235  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  40.87 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.56 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  41.69 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  41.69 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.94 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  40.06 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  41.69 
 
 
336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  39.58 
 
 
336 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  41.4 
 
 
336 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
339 aa  232  6e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  38.2 
 
 
316 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
338 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
319 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.94 
 
 
336 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0871  inner membrane ABC transporter permease protein  36.15 
 
 
342 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  38.6 
 
 
336 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  39.18 
 
 
336 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  38.64 
 
 
336 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
358 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>