More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2378 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
433 aa  896    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  61.74 
 
 
586 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  67.53 
 
 
826 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  62.12 
 
 
742 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  65.56 
 
 
751 aa  363  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  66.67 
 
 
517 aa  363  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  63.93 
 
 
829 aa  363  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  60.37 
 
 
319 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  62.36 
 
 
325 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  59.52 
 
 
267 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  57.35 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  54.48 
 
 
398 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  51.84 
 
 
517 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  42.34 
 
 
1911 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  43.32 
 
 
620 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  41.26 
 
 
269 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  41.85 
 
 
621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 
625 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  41.04 
 
 
358 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  43.17 
 
 
636 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  42.54 
 
 
820 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  42.29 
 
 
637 aa  176  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  41.2 
 
 
603 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  40.28 
 
 
1132 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
617 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  39.79 
 
 
527 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  41.27 
 
 
781 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  41.26 
 
 
892 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  40.15 
 
 
287 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  37.23 
 
 
1104 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  40.89 
 
 
616 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 
882 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  40.73 
 
 
740 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  37.31 
 
 
802 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  41.76 
 
 
877 aa  170  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  39.35 
 
 
623 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  39.7 
 
 
620 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  40.96 
 
 
862 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 
593 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  37.91 
 
 
637 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  36.51 
 
 
538 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  38.97 
 
 
929 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  35.59 
 
 
426 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  35.64 
 
 
346 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  36.86 
 
 
489 aa  159  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  38.23 
 
 
664 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  38.4 
 
 
522 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  38.74 
 
 
925 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.95 
 
 
416 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  37.19 
 
 
1196 aa  156  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  36.51 
 
 
351 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  37.02 
 
 
312 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  38.85 
 
 
293 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
618 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  38 
 
 
1581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  37.23 
 
 
600 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  35.24 
 
 
338 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  38.23 
 
 
301 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  37.23 
 
 
549 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  37.22 
 
 
289 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  34.87 
 
 
584 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  37.89 
 
 
359 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  35.59 
 
 
654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  36.71 
 
 
281 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  38.1 
 
 
768 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  35.79 
 
 
334 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  31.8 
 
 
287 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  37.19 
 
 
305 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  34.56 
 
 
453 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  35.14 
 
 
446 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  29.44 
 
 
409 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
303 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  35.03 
 
 
358 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  34.05 
 
 
336 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  36.14 
 
 
300 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  32.82 
 
 
375 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  29.74 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  30.58 
 
 
390 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.55 
 
 
348 aa  136  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  33.74 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  35.16 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  34.11 
 
 
390 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  28.77 
 
 
384 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  35.31 
 
 
348 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.93 
 
 
554 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  34.35 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  36.4 
 
 
692 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  30.06 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  37.27 
 
 
291 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  33.08 
 
 
298 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  35.74 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  30.06 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  30.89 
 
 
330 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  36.8 
 
 
668 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  33 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>