More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1865 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  76.2 
 
 
768 aa  1165    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  82.15 
 
 
770 aa  1191    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  76.36 
 
 
762 aa  1125    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
758 aa  1526    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  80.39 
 
 
770 aa  1191    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0850  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  74.71 
 
 
750 aa  1092    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  78.42 
 
 
759 aa  1182    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5217  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.4 
 
 
693 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.3 
 
 
667 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.6 
 
 
667 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.09 
 
 
710 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  40.49 
 
 
695 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.42 
 
 
656 aa  429  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.9 
 
 
628 aa  425  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  40.41 
 
 
696 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.05 
 
 
651 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.35 
 
 
676 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  37.58 
 
 
636 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  41.48 
 
 
715 aa  416  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.93 
 
 
637 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  40.93 
 
 
669 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  40.99 
 
 
682 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  39.12 
 
 
724 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.03 
 
 
666 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  44.83 
 
 
667 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  40.2 
 
 
679 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  40.2 
 
 
679 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  40.61 
 
 
679 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  40.83 
 
 
720 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  40.2 
 
 
679 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  40.2 
 
 
679 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4909  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.92 
 
 
635 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  38.8 
 
 
688 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.48 
 
 
678 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  40.61 
 
 
679 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  40.61 
 
 
679 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.87 
 
 
670 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.14 
 
 
642 aa  399  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.71 
 
 
642 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  47.92 
 
 
669 aa  399  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  41.43 
 
 
711 aa  398  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  41.41 
 
 
692 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  42.77 
 
 
686 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.71 
 
 
645 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01681  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  36.72 
 
 
673 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.92 
 
 
624 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  44.38 
 
 
620 aa  392  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  40.19 
 
 
695 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  41.98 
 
 
686 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.67 
 
 
658 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564852  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2616  NADH dehydrogenase I chain L  43.25 
 
 
685 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  49.17 
 
 
687 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  50.23 
 
 
686 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  40.08 
 
 
670 aa  389  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.93 
 
 
675 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.58 
 
 
671 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.66 
 
 
630 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  38.49 
 
 
706 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.34 
 
 
678 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.4 
 
 
702 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  41.02 
 
 
685 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  47.18 
 
 
663 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.16 
 
 
634 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.28 
 
 
667 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  46.85 
 
 
650 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  44.26 
 
 
713 aa  385  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  43.95 
 
 
713 aa  385  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  39.05 
 
 
701 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  46.58 
 
 
668 aa  386  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.89 
 
 
671 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.82 
 
 
681 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.05 
 
 
666 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0694  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.21 
 
 
672 aa  382  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  45.58 
 
 
617 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.33 
 
 
650 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  40.23 
 
 
684 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.21 
 
 
674 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  39.57 
 
 
692 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.2 
 
 
672 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  40.23 
 
 
684 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.12 
 
 
653 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  40.23 
 
 
684 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0877  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.57 
 
 
648 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  45.45 
 
 
620 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  41.21 
 
 
684 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.94 
 
 
662 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  44.89 
 
 
620 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  38.75 
 
 
719 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  43.1 
 
 
691 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.65 
 
 
673 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  40.23 
 
 
684 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0151  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  42.96 
 
 
673 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.16 
 
 
610 aa  379  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  38.64 
 
 
681 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.07 
 
 
704 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.02 
 
 
686 aa  375  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1515  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  46.23 
 
 
668 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.58 
 
 
676 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.56 
 
 
639 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.56 
 
 
639 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>