More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0109 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0109  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 92 aa  190  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199865  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0096  30S ribosomal protein S18  85.87 
 
 		 92 aa  166  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0149  30S ribosomal protein S18  89.13 
 
 		 87 aa  163  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000094282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0116  30S ribosomal protein S18  88.04 
 
 		 90 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2510  30S ribosomal protein S18  86.96 
 
 		 87 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000155943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0164  30S ribosomal protein S18  93.51 
 
 		 87 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0160  30S ribosomal protein S18  93.51 
 
 		 78 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000343097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  50.82 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  49.18 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  49.18 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  50.82 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  45.76 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  45.76 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  57.41 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  50 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  43.55 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  43.55 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  41.94 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  54.39 
 
 		 90 aa  67  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  52.83 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  45.16 
 
 		 77 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  45.16 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  44.29 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  53.7 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  48.39 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  48.33 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  54.72 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  54 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  53.7 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0899  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0242171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2304  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  54.9 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  53.7 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  53.7 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  46.55 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  40.51 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1621  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0249871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3745  30S ribosomal protein S18  50.88 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00458678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  49.15 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  46.55 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  47.46 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  43.04 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  48.28 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  54 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  42.11 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  50.98 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  50 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  51.92 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  43.1 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0740  30S ribosomal protein S18  49.06 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  52.83 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2463  30S ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  47.17 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  62 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  49.02 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  47.46 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03777  30S ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  36.9 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  46.55 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  45 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  46.55 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3814  30S ribosomal protein S18  48.08 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295923  normal  0.120309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>