176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1856 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  100 
 
 		 129 aa  266  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  79.07 
 
 		 88 aa  146  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  44.72 
 
 		 135 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  43.75 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  41.79 
 
 		 412 aa  104  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  42.64 
 
 		 406 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  37.23 
 
 		 410 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  43.2 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  40.58 
 
 		 407 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  41.41 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  44.86 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  35.77 
 
 		 410 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  43.55 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  41.27 
 
 		 405 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  35.51 
 
 		 406 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  37.04 
 
 		 406 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  42.74 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  44.14 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  36.3 
 
 		 407 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  39.34 
 
 		 402 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  42.99 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  35.56 
 
 		 406 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  39.67 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  37.01 
 
 		 418 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  39.69 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  35.77 
 
 		 409 aa  90.5  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  40 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  35.94 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  33.58 
 
 		 409 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  36.09 
 
 		 408 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  38.74 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  32.12 
 
 		 415 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  40.52 
 
 		 410 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  40.35 
 
 		 405 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  32.12 
 
 		 405 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  40.5 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  40.5 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  39.67 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  40 
 
 		 423 aa  83.6  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  39.67 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  39.67 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  40.5 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  39.2 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  40 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  33.08 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  36.28 
 
 		 413 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  35.58 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  33.33 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  35.16 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  37.8 
 
 		 408 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  34.65 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  35.94 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  37.01 
 
 		 408 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  34.21 
 
 		 397 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  32.5 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  30.83 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  32.82 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  30.83 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  37.76 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  31.3 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  41.12 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  32.73 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  33.87 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  32.74 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  32.74 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  32.74 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  38.95 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  32.74 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  31.86 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  34.95 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  31.86 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  31.86 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  31.86 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  31.86 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  31.86 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  31.86 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  31.86 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  31.25 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  27.45 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  29.46 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  29.46 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  33.96 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01800  OsmC-like protein  34 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0270065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0089  OsmC family protein  31.63 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0334  OsmC family protein  31.58 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0104  OsmC family protein  31.63 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  30.69 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  33.04 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0104  OsmC family protein  30.61 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000509604 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  25.2 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5463  osmotically inducible protein OsmC  32.97 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  22.76 
 
 		 728 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0585  osmotically inducible protein OsmC  30.69 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  25 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2238  OsmC family protein  30.69 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8088  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  25.47 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2314  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  27.88 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  22.13 
 
 		 728 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0107  OsmC family protein  29.59 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0674  OsmC family protein  29.29 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.951893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>