87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1099 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  100 
 
 		 329 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.45 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  35.17 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  35.62 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 295 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  35.4 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.05 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  35 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  36 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  32.92 
 
 		 640 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  35.69 
 
 		 296 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  35.69 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  27.69 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  33.87 
 
 		 317 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  33.76 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  31.42 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  29.7 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.47 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  47.86 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  50.43 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  48.67 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  48.67 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.9 
 
 		 584 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  45.1 
 
 		 120 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 526 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  23.75 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  24.23 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 524 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0579  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0563858  normal  0.638168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  27.35 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>