More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4281 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 405 aa  818    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  62.72 
 
 		 405 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  64.6 
 
 		 402 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  64.85 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  62.96 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  57.21 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  57.32 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  57.58 
 
 		 415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  56.57 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 421 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 436 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 389 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  27.82 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 		 405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  24.87 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  26.89 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 405 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 409 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.32 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.38 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 1340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.62 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.86 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  30.53 
 
 		 442 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 703 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 456 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 429 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  24.38 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.17 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  26.9 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  28.44 
 
 		 420 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  25.71 
 
 		 408 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  32.95 
 
 		 443 aa  86.3  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  24.58 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  39.2 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  25.84 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 		 956 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  36.21 
 
 		 860 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 		 994 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 		 902 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  38.66 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 1156 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  30.51 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.93 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 		 1348 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>