276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4275 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  100 
 
 		 379 aa  753    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  54.11 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  53.54 
 
 		 356 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  30.68 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  29.81 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  28.96 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  32.69 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  29.11 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  26.5 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  28.26 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  34.45 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  30.84 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  30.48 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  31.16 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  29.92 
 
 		 342 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  29.83 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  28.26 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  31.39 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  27.8 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  28.57 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  31.39 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  29.72 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  26.76 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  32.56 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  30.84 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  30.9 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  28.76 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  31.33 
 
 		 367 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  29.97 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  30.3 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  29.64 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  28.88 
 
 		 338 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  29.7 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  32.57 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  31.7 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  30.57 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.95 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  29.81 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  28.78 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  28 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  30.03 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  31.39 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  29.23 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  28.73 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  28.4 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  29.36 
 
 		 658 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  30.62 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  27.89 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  28.13 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  28.25 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  25.41 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  26.6 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  26.4 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  26.4 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.17 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  27.66 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  26.18 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  28.96 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  28.61 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  31.93 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  25.33 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  25.82 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  31.19 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  21.56 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  26.9 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  30.86 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  26.71 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  28.14 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  30.73 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  24.46 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  25.61 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  33.14 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  27.25 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  25.26 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  26.3 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  27.78 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  29.57 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  28.91 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  29.02 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  28.22 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  33.33 
 
 		 660 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  28.36 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  26.06 
 
 		 635 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  27.02 
 
 		 647 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  26.87 
 
 		 629 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  32.3 
 
 		 671 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.71 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  27.02 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  28.57 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  26.86 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  32.93 
 
 		 660 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  34.25 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  30.95 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  26.71 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>