More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3359 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  98.59 
 
 
354 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  100 
 
 
354 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  94.63 
 
 
364 aa  621  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  95.48 
 
 
354 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  95.76 
 
 
354 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2114  acyltransferase 3  96.61 
 
 
354 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4396  acyltransferase 3  96.01 
 
 
326 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  74.2 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0691  acyltransferase family protein  82.84 
 
 
379 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  80.7 
 
 
352 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2433  putative acyltransferase  80.7 
 
 
352 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142422  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  80.41 
 
 
352 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  80.41 
 
 
352 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  80.41 
 
 
352 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  80.41 
 
 
352 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  80.41 
 
 
352 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  75.98 
 
 
372 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  75.68 
 
 
366 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  46.31 
 
 
346 aa  258  9e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  33.13 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  32.48 
 
 
392 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3303  acyltransferase 3  36.45 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198239  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  32.37 
 
 
734 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  35.16 
 
 
679 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  32.91 
 
 
696 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  34.87 
 
 
681 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  29.5 
 
 
386 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  30.66 
 
 
656 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  33.9 
 
 
382 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  34.65 
 
 
638 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.92 
 
 
667 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  33.55 
 
 
634 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  31.94 
 
 
662 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  33.55 
 
 
660 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  31.28 
 
 
695 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  28.8 
 
 
622 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  32.49 
 
 
682 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  25.13 
 
 
366 aa  96.3  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.02 
 
 
656 aa  95.9  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  31.83 
 
 
673 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  31.37 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  34.53 
 
 
632 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.49 
 
 
629 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  30.54 
 
 
583 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  40.09 
 
 
376 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  30.81 
 
 
643 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  28.46 
 
 
710 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  28.46 
 
 
710 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  29.08 
 
 
386 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.51 
 
 
695 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  41.01 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  31.94 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  29.58 
 
 
675 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  29.73 
 
 
660 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  33.12 
 
 
645 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  31.83 
 
 
716 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  30.94 
 
 
377 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  32.48 
 
 
684 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  31.78 
 
 
690 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  29.92 
 
 
435 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  40 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  36.68 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  31.64 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29.75 
 
 
635 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  30.5 
 
 
690 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  33.65 
 
 
630 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  31.07 
 
 
360 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  30.91 
 
 
607 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  29.97 
 
 
399 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28.44 
 
 
660 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.19 
 
 
660 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  31.42 
 
 
695 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  30.65 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  29.28 
 
 
671 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  30.09 
 
 
690 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  32.41 
 
 
671 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  29.3 
 
 
604 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  30.88 
 
 
629 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  30.84 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  26.46 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  29.3 
 
 
604 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  33.23 
 
 
637 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  29.7 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  31.17 
 
 
658 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  30.97 
 
 
365 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  30.06 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.18 
 
 
629 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  31.65 
 
 
640 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31.18 
 
 
647 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  29.41 
 
 
660 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  42 
 
 
656 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.13 
 
 
616 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  35.89 
 
 
632 aa  82.8  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  33.23 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  29.38 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  33.77 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  31.63 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  35.93 
 
 
711 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  29.6 
 
 
715 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  36.99 
 
 
651 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>