More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4008 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  73.54 
 
 		 223 aa  338  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  73.99 
 
 		 240 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  74.21 
 
 		 223 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  73.3 
 
 		 223 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  72.85 
 
 		 223 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  72.85 
 
 		 223 aa  320  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  73.33 
 
 		 210 aa  317  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  76.44 
 
 		 222 aa  311  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  69.82 
 
 		 224 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  69.37 
 
 		 224 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  62.44 
 
 		 223 aa  254  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  56.7 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  58.9 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  60.27 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  58.41 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  53.56 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  55.84 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  56.89 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  55.5 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  55.86 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  58.06 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  55.26 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  56.64 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  55.26 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  53.71 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  53.78 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  54.82 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  54.82 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  54.82 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  52.54 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  52.89 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  54.46 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  52.38 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  50.22 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  52.91 
 
 		 221 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  49.36 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  49.79 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  51.98 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  50.87 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  53.67 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  50.44 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  48.33 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  51.32 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  53.95 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  49.12 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  51.12 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  47.71 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  50.44 
 
 		 222 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  49.79 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  50 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  46.79 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  50 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  46.72 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  49.33 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  50 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  52.94 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  52.94 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  46.72 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  46.33 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  46.26 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  46.26 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  45.02 
 
 		 232 aa  187  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  46.22 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  46.75 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  45.3 
 
 		 241 aa  184  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  47.35 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  43.46 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  44.83 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  44.02 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  43.78 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  43.35 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  43.35 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  43.35 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  43.35 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  43.35 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  43.35 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  43.35 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  43.35 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  43.35 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  43.78 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  46.67 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  43.1 
 
 		 231 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  43.59 
 
 		 239 aa  167  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  46.89 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  46.38 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  44.98 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  45.71 
 
 		 271 aa  158  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  45.71 
 
 		 271 aa  158  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  43.61 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  47.11 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  46.03 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  43.05 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  40.66 
 
 		 274 aa  141  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  40.77 
 
 		 272 aa  138  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  37.93 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  39.42 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  36.21 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>