41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1691 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  333  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  70.3 
 
 		 172 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  68.94 
 
 		 175 aa  226  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  68.94 
 
 		 175 aa  226  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  69.33 
 
 		 167 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  68.71 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  67.47 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  65.84 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  65.84 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  65.84 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  70.77 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  33.75 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  28.19 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  31.72 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  27.59 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  34.75 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  34.75 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  44 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  43.59 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  42.67 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  29.63 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  41.33 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  26.43 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  37.25 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  23.64 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2902  hypothetical protein  35.71 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189219 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  23.03 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  45.28 
 
 		 174 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  29.21 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1072  hypothetical protein  31.51 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3141  hypothetical protein  32.52 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  35.09 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  32.84 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  26.96 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1555  hypothetical protein  22.02 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.040655  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1071  hypothetical protein  27.87 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0314425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  37.84 
 
 		 140 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  40.48 
 
 		 181 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  35.9 
 
 		 178 aa  40.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>