264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0216 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 305 aa  613  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  42.16 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  43.89 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  40.45 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  39.81 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  38.16 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  37.79 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  35.31 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0217  flagellar hook-associated protein FlgL  31.6 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  32.57 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  36.51 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  36.51 
 
 		 305 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  32.13 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  29.9 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0194  flagellar hook-associated protein FlgL  33.23 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0247  flagellar hook-associated protein FlgL  32.37 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  28.53 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  28.76 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  33.1 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  24.23 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  25.09 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  33.95 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  32.82 
 
 		 404 aa  99.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  27.88 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  33.89 
 
 		 562 aa  99  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  32.07 
 
 		 396 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  31.03 
 
 		 439 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  35.46 
 
 		 416 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  29.89 
 
 		 402 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  30.98 
 
 		 521 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  30.47 
 
 		 396 aa  93.2  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  26.15 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  29.35 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  27.96 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  27.96 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  26.16 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  30.27 
 
 		 401 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 		 411 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  30.11 
 
 		 408 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 		 530 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  23.2 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  32.39 
 
 		 410 aa  89.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  30.52 
 
 		 523 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  32.94 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  29.73 
 
 		 396 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  32.22 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  33.11 
 
 		 412 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  25.72 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  25.55 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  30.77 
 
 		 400 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  29.73 
 
 		 400 aa  85.9  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  28.65 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  24.68 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  29.35 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  24.51 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  31.25 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  28.65 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  34.62 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.65 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.07 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  28.65 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.11 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  26.64 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.35 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  28.65 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  28.65 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  24.53 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  30.13 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  30.13 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  30.13 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  30.13 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  30.13 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  30.13 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  30.13 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  28.39 
 
 		 524 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  26.23 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  25.08 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  24.21 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  26.23 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.87 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  25.08 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  25.9 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  24.21 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  24.21 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>