165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0649 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
305 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0217  flagellar hook-associated protein FlgL  83.39 
 
 
307 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  32.57 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  28.53 
 
 
309 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  28.53 
 
 
309 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  29.51 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  28.71 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  28.98 
 
 
304 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  30.49 
 
 
305 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  28.37 
 
 
305 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  27.07 
 
 
296 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  28.37 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  27.97 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  27.39 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  27.01 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  30.37 
 
 
523 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  26.3 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0194  flagellar hook-associated protein FlgL  26.56 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  27.84 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  30.36 
 
 
562 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  28.26 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  29.81 
 
 
521 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  28.96 
 
 
532 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0247  flagellar hook-associated protein FlgL  25.39 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  27.72 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  23.16 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  26.73 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  26.52 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  24.89 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  27.72 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  27.13 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  26.7 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  25.74 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  25.67 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  22.95 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  26.57 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  26.58 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  25.96 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  29.1 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  24.86 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  25.51 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  24.86 
 
 
403 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
403 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  24.32 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  24.02 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  24.46 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  24.32 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  24.32 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  26.62 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  26.62 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  22.22 
 
 
530 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  23.9 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  23.9 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  23.9 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  23.9 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  23.9 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  25.68 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 
520 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3573  flagellar hook-associated protein 3  22.41 
 
 
436 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  23.51 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  22.54 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  24.12 
 
 
317 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  25.15 
 
 
317 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  25.15 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  25.15 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  25.15 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  22.29 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  24.12 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  22.29 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  23.08 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  30.1 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
412 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  22.41 
 
 
420 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  20.77 
 
 
530 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  27.15 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  22.22 
 
 
408 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  25.85 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.36 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  23.97 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  24.73 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  23.72 
 
 
295 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  22.82 
 
 
406 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  23.71 
 
 
400 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  24.06 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
411 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  24.68 
 
 
408 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  24.36 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.63 
 
 
410 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  22.36 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
411 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  26.67 
 
 
416 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  26.97 
 
 
521 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  21.84 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  25.53 
 
 
870 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  23.08 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  27.67 
 
 
514 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  22.05 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  21.94 
 
 
404 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  27.75 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>