More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1107 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1107  sun protein  100 
 
 		 471 aa  969    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  38.7 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.32 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  38 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  36.15 
 
 		 443 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  36.19 
 
 		 446 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  36.15 
 
 		 452 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  36.43 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  36.99 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  36.99 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  34.93 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  35.47 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  37.18 
 
 		 443 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.47 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.6 
 
 		 429 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.64 
 
 		 440 aa  230  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  32.77 
 
 		 448 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  32.34 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  34.47 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  32.53 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  33.62 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  32.96 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  32.73 
 
 		 453 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.39 
 
 		 444 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  34 
 
 		 452 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  33.57 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  33.41 
 
 		 432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  34.53 
 
 		 451 aa  216  8e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  31.85 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.05 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.22 
 
 		 452 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  33.62 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  34.37 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  34.05 
 
 		 447 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  30.95 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  30.95 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  30.95 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  32.9 
 
 		 450 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  31.19 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  30.47 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  30.71 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  30.71 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  30.71 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  30.71 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  32.94 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  30.71 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  30.95 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  32.31 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.12 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  30.24 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  32.09 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  32.09 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  29.55 
 
 		 435 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  29.55 
 
 		 435 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0561  sun protein  31.51 
 
 		 412 aa  197  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.494153 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  31.02 
 
 		 430 aa  197  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  32.15 
 
 		 447 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.86 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  31.6 
 
 		 449 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.32 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.08 
 
 		 436 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  30.05 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  31.89 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.98 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.02 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  29.27 
 
 		 442 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  31.56 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  34.26 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  30.9 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  31.43 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  31.73 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.11 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  31.86 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  31.87 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.26 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  33.26 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.18 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  33.02 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.1 
 
 		 429 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  32.7 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  33.57 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  33.83 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33.83 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  33.83 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  33.83 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  34.09 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  33.83 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  24.83 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  33.41 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  34.09 
 
 		 429 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  31.89 
 
 		 462 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  33.83 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  32.75 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  33.33 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  32.49 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  33.83 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  32.25 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  33.01 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  33.01 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  32.78 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>