More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1075 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  100 
 
 		 372 aa  745    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  82.49 
 
 		 403 aa  618  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  75.96 
 
 		 381 aa  590  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  77.65 
 
 		 385 aa  587  1e-166  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  46.22 
 
 		 409 aa  323  4e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  48.65 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  39.52 
 
 		 436 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  37.2 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  34.12 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  35.99 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  36.07 
 
 		 489 aa  199  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  35.79 
 
 		 489 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  35.62 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  36.92 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  36.23 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  37.39 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  38.25 
 
 		 414 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  36.64 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  36.21 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  37.64 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  35.69 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  40.11 
 
 		 509 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  39.1 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  36.98 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  34.45 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  35.67 
 
 		 450 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  37.67 
 
 		 436 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  34.79 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  34.31 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  37.21 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  37.81 
 
 		 503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  38.6 
 
 		 596 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  34.08 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  37.36 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  37.36 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  37.36 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  35.63 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  38.79 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  36.97 
 
 		 434 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  36.49 
 
 		 460 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  35.34 
 
 		 428 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  36.75 
 
 		 442 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  36.02 
 
 		 441 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  37.64 
 
 		 433 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  36.71 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  37.75 
 
 		 433 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  34.86 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  35.77 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  34.82 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  35.98 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  34.75 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  35.21 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  36.44 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  36.44 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  37.78 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  35.77 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  35.47 
 
 		 414 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  34.32 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  36.57 
 
 		 396 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  35.03 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  36.19 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  37.04 
 
 		 479 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  37.69 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  37.24 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.35 
 
 		 487 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  35.5 
 
 		 484 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  36.64 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  35.94 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  36.64 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  35.48 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  36.64 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  36.96 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  34.62 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  36.64 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  36.64 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  39.8 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  35.65 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  35.62 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  35.5 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  36.57 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  36.29 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  34.62 
 
 		 450 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  36.36 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  35.65 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  35.65 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.36 
 
 		 493 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  34.68 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  34.66 
 
 		 419 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  36.01 
 
 		 395 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  36.34 
 
 		 396 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  36.34 
 
 		 396 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  36.01 
 
 		 395 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  36.34 
 
 		 396 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  37.1 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  36.29 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  36.98 
 
 		 485 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  34.97 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  35.65 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  36.15 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  36.51 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>