85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0069 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  100 
 
 
475 aa  973    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  89.47 
 
 
474 aa  878    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  59.24 
 
 
599 aa  223  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  51.42 
 
 
589 aa  221  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.95 
 
 
748 aa  93.2  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.51 
 
 
651 aa  91.3  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  30.69 
 
 
803 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.58 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.16 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  34.36 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.12 
 
 
465 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  30.2 
 
 
523 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.54 
 
 
683 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  29.12 
 
 
459 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  29.12 
 
 
459 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.61 
 
 
606 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  25.5 
 
 
524 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  29.21 
 
 
609 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  29.21 
 
 
609 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  26.17 
 
 
539 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  27.63 
 
 
743 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.78 
 
 
819 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.9 
 
 
729 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  27.92 
 
 
587 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  30.65 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  29.12 
 
 
899 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.51 
 
 
743 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.65 
 
 
626 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  30.46 
 
 
853 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.49 
 
 
308 aa  53.9  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.64 
 
 
822 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  30.22 
 
 
629 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.11 
 
 
698 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  28.5 
 
 
805 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  29.05 
 
 
781 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.15 
 
 
754 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.44 
 
 
343 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.829729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  37.36 
 
 
264 aa  50.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.44 
 
 
421 aa  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  28.02 
 
 
810 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0910  ATPase  34.4 
 
 
314 aa  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.61 
 
 
502 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.99 
 
 
530 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  27.81 
 
 
655 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
398 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3709  ATPase  30.17 
 
 
316 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  34.86 
 
 
603 aa  47  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  44.62 
 
 
639 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  25.98 
 
 
337 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  25.64 
 
 
734 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  24.81 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  30.82 
 
 
323 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.23 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.8 
 
 
585 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.37 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  30 
 
 
705 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2074  ATPase  31.39 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  26.47 
 
 
741 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  32.11 
 
 
598 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  25.61 
 
 
668 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.23 
 
 
568 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  31.62 
 
 
435 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.4 
 
 
315 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  27.41 
 
 
571 aa  43.9  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.4 
 
 
378 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  26.87 
 
 
371 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  31.54 
 
 
385 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  34.65 
 
 
662 aa  43.9  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  31.97 
 
 
377 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3516  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.18 
 
 
346 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3221  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.18 
 
 
346 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  29.36 
 
 
303 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  26.89 
 
 
653 aa  43.5  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  26.42 
 
 
678 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  36.63 
 
 
517 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.27 
 
 
302 aa  43.5  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  32.52 
 
 
386 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.24 
 
 
732 aa  43.5  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  32.03 
 
 
370 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  32.32 
 
 
779 aa  43.5  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  30.63 
 
 
843 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  30.63 
 
 
847 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  27.1 
 
 
437 aa  43.1  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  27.78 
 
 
437 aa  43.1  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>