185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3568 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  38.21 
 
 
299 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  37.87 
 
 
299 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  29.9 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  28.06 
 
 
305 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  29.68 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  28.57 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0217  flagellar hook-associated protein FlgL  27.64 
 
 
307 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  26.86 
 
 
309 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  25.57 
 
 
304 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  26.86 
 
 
309 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  28.03 
 
 
305 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  27.07 
 
 
305 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  27.56 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  26.75 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  26.75 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  27.13 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.43 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  27.13 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  27.13 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  26.81 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  27.13 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  27.39 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
562 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  30.23 
 
 
420 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  24.58 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0194  flagellar hook-associated protein FlgL  25.63 
 
 
304 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  34.69 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.62 
 
 
311 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  31.79 
 
 
400 aa  85.5  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  30.97 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  30.97 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0247  flagellar hook-associated protein FlgL  25.72 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.45 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  32.39 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  30.82 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  24.54 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  24.54 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  25.08 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  27.4 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  29.7 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  29.45 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  23.58 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  30.32 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  28.77 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  32.64 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  29.45 
 
 
416 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  28.77 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  27.62 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  30.92 
 
 
400 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  31.76 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  26.97 
 
 
401 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  28.39 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  24.69 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  28.48 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  26.71 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  34.03 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.4 
 
 
403 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  27.57 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  27.4 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  32.88 
 
 
521 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.4 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  24.54 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  28.77 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  23.3 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  27.4 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  27.59 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  26.11 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  29.33 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  27.4 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  28.18 
 
 
523 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  28.07 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  28.25 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  28.07 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  29.94 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  28.08 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  24.83 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  27.78 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.26 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  29.14 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27.7 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  26.03 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  25.83 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  25.83 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  25.83 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  25.83 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>