More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2918 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  100 
 
 		 211 aa  410  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  53.59 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  52.13 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  52.13 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  52.13 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  52.13 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  51.66 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.66 
 
 		 212 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  51.66 
 
 		 212 aa  218  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  51.66 
 
 		 212 aa  218  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  50.71 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  50.71 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  50.71 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  50.71 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  50.71 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  50.71 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  49.28 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  49.28 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  43.87 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  43.87 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  43.87 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  44.34 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  43.06 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  42.92 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  43.87 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  42.59 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  44.79 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  44.79 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  44.79 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  44.79 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  44.79 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  44.79 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  44.79 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  45.45 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  45.03 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  42.45 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  40.65 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  42.01 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  41.4 
 
 		 220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  41.2 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  41.2 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  44.08 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  40.82 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.81 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  39.25 
 
 		 218 aa  153  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.14 
 
 		 216 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.13 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  38.07 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  31.72 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.22 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.8 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  27.8 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  27.18 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.3 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  33.87 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.92 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  25.85 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  25.6 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.88 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.89 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  26.64 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.78 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  30.11 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.77 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.5 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.24 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.57 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  27.67 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.14 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.08 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  24.76 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  24.76 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  24.76 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  26.21 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  24.76 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>