More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2698 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2698  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.089353  normal  0.418887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  85.71 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  87.14 
 
 		 69 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  82.86 
 
 		 70 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  81.43 
 
 		 70 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  82.86 
 
 		 70 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  85.07 
 
 		 69 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0051  cold shock protein  83.33 
 
 		 69 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2622  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.47 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2689  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.47 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1469  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.47 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1648  cold shock domain-contain protein  75 
 
 		 69 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2883  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 		 69 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1500  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 69 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 69 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  76.47 
 
 		 70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001501  cold shock transcriptional regulator CspA  75.71 
 
 		 70 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.103059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1366  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.53 
 
 		 69 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  75.71 
 
 		 70 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1165  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.36 
 
 		 69 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.29 
 
 		 70 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  71.43 
 
 		 70 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03487  putative cold shock-like protein cspG  70.59 
 
 		 69 aa  103  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  70 
 
 		 70 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1840  cold-shock DNA-binding domain protein  70 
 
 		 70 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06418  hypothetical protein  70 
 
 		 70 aa  100  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 69 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.57 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2122  cold-shock DNA-binding domain protein  67.14 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 69 aa  98.2  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  73.44 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.97 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.57 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  70.97 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  70.97 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0614  cold shock-like protein  68.66 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.099487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2559  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0164583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0166  major cold shock protein  62.86 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0482  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0899  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1853  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537737  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0167  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0388  cold shock transcription regulator protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1944  hypothetical protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1442  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 69 aa  93.6  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4995  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.18 
 
 		 68 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00992  DNA-binding transcriptional regulator  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2653  cold-shock DNA-binding domain protein  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000496106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2326  cold shock protein CspG  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1105  cold shock protein CspG  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000233553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2607  cold shock protein CspG  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1099  cold shock protein CspG  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2135  cold shock protein CspG  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.97 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6397  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1225  cold shock protein CspG  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000203795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1002  cold-shock domain-contain protein  64.62 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00999  hypothetical protein  61.43 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.14 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  67.19 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5524  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337597  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5888  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232235  normal  0.225892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0201  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.29 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.766684  hitchhiker  0.00947065 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3041  cold shock transcription regulator protein  66.15 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000233724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1594  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000000000225603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2941  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000529081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3007  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000126299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>