More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4172 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 154 aa  314  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  74.68 
 
 		 154 aa  239  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  72.73 
 
 		 154 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  72.73 
 
 		 154 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  73.38 
 
 		 154 aa  234  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  72.73 
 
 		 154 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  68.83 
 
 		 154 aa  223  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  69.48 
 
 		 154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  64.29 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  58.17 
 
 		 160 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 		 160 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 		 160 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  57.24 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  57.42 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  56.86 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  54.84 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  50.66 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  54 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  47.8 
 
 		 165 aa  155  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  50.67 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  53.55 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  53.42 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  47.62 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  53.29 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  56.38 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  53.95 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  53.02 
 
 		 175 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  51.97 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  47.8 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  54.11 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  54.11 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  54.11 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  54.11 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  54.11 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  54.11 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  54.11 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  52.29 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  55.1 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  50.65 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  51.33 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  54.19 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  52.63 
 
 		 171 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  53.9 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  51.32 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  51.35 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.77 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2038  protein tyrosine phosphatase  54.48 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  54.11 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  51.68 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  48.39 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  53.38 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  51.37 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  51.37 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  51.32 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  48.99 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.03 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  51.37 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  47.62 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  48.73 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  47.74 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 163 aa  140  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.73 
 
 		 453 aa  140  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.37 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  48.7 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.92 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1881  protein tyrosine phosphatase  51.05 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  46.98 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  48.34 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  48.72 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  50.75 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  49.63 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  50.96 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  43.56 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.11 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.34 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.74 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.11 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  50.67 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.11 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  42.11 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  42.11 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.97 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.11 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>