68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3670 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  65.16 
 
 		 258 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  64.49 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  64.37 
 
 		 258 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  63.11 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  48.78 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  53.08 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  52.56 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  47.93 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  47.93 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  47.93 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  48.48 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  47.52 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  47.52 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  47.52 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  47.52 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  45.95 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  43.44 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  40.71 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  40.71 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  40.65 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  40.71 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  41.39 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  36.04 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  36.76 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  35.42 
 
 		 244 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  33.48 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  32.38 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  30.88 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  35.93 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  31.42 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  33.65 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  30.97 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  30.97 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  30.97 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  30.97 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  30.97 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  30.97 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.17 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  30.29 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  27.73 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  27.73 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.07 
 
 		 236 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.13 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.46 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  28.16 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  29.33 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  31.03 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  25.73 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  25.12 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  24.69 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  26.18 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  25.1 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  30.46 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  26.92 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  23.33 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  24.22 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  20.26 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  24.12 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.03 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  21.76 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  28.7 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  31.94 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2407  putative periplasmic chaperone protein  33.33 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  22.5 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  24.15 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  23.98 
 
 		 250 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  23.01 
 
 		 234 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>