59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1055 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  72.85 
 
 		 229 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  72.85 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  59.91 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  63.43 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  59.03 
 
 		 221 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  62.1 
 
 		 229 aa  261  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  61.57 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  61.19 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  42.33 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  39.3 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  39.3 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  39.3 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  39.3 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  39.33 
 
 		 250 aa  154  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  38.96 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  41.28 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  40.62 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  40.37 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  37.12 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  37.12 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  37.12 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  38.18 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  37.39 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  36.96 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  31.96 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  38.43 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  32.07 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  32.07 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  43.54 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  43.54 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  27.03 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  27.03 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  26.17 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  24.29 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.29 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  24.29 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.48 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  27.48 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  25.87 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 		 163 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0080  CheW protein  24.49 
 
 		 143 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0672928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  23.08 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  26.62 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  26.62 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.27 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  26.45 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.9 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  27.05 
 
 		 140 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.81 
 
 		 163 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.34 
 
 		 164 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  27.54 
 
 		 159 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  24.53 
 
 		 164 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.53 
 
 		 164 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  24.53 
 
 		 164 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  24.53 
 
 		 164 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  22.38 
 
 		 154 aa  42  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  25.17 
 
 		 155 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>