More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4087 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 350 aa  731    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  25.82 
 
 		 365 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  24.04 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 548 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  32 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  40.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  32 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  44.71 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  39.78 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 544 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  36.19 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  33.01 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40.62 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  35.51 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  31 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  31 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  31 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  31 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  31 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  32.43 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001306  putative ARAC-type regulatory protein  33.7 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  33.7 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  33.91 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 600 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  32.08 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  32.08 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  38 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 1201 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 502 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 146 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>