164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2056 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2056  porin Gram-negative type  100 
 
 		 368 aa  736    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  58.18 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1637  porin Gram-negative type  56.54 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000904946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1666  porin Gram-negative type  54.02 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000017605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1665  porin Gram-negative type  52.66 
 
 		 376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000257252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1636  porin Gram-negative type  52.99 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00881116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  50.8 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  49.21 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  49.21 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  49.21 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  49.48 
 
 		 362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  49.21 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  49.21 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  49.48 
 
 		 362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  48.95 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  49.1 
 
 		 383 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  49.61 
 
 		 369 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  48.4 
 
 		 359 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  48.18 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  48 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  46.22 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  47.12 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  47.64 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  47.94 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  47.94 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  47.94 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  47.12 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  47.44 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  47.94 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  47.94 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  45.03 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  48.01 
 
 		 367 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  48.01 
 
 		 368 aa  301  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  47.93 
 
 		 376 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  47.53 
 
 		 376 aa  301  9e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  46.97 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  46.97 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  46.97 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  49.35 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  46.7 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  48.7 
 
 		 380 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  48.67 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  46.22 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  48.53 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  48.72 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  46.22 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  48.84 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  46.22 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  45.79 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  46.22 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  49.74 
 
 		 360 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  48.54 
 
 		 367 aa  295  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  45.89 
 
 		 360 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  45.95 
 
 		 351 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  46.86 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  46.86 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  46.86 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  48.68 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  48.68 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  45.68 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  47.26 
 
 		 378 aa  292  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  44.74 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  45.93 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  45.93 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  45.41 
 
 		 351 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  45.14 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  45.14 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  45.14 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  45.14 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  45.86 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  47.37 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  45.86 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  44.86 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2269  porin Gram-negative type  45.18 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.421789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01348  outer membrane pore protein N, non-specific  44.9 
 
 		 377 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  44.9 
 
 		 377 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  44.9 
 
 		 377 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  44.9 
 
 		 377 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  44.9 
 
 		 377 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  47.12 
 
 		 398 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1614  outer membrane protein N  44.9 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.51983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1776  outer membrane protein N  47.21 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  46.26 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  45.31 
 
 		 366 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  45.64 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  45.48 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  45.48 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  45.48 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  43.7 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  45.05 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  43.86 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  43.86 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  43.86 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  43.86 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  43.86 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1589  outer membrane porin protein LC  45.38 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.810656  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  42.42 
 
 		 372 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  42.21 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  42.21 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  42.21 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>