More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2540 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2540  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.52918e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  43.2 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  39.68 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  41.6 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  39.2 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  36.8 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  37.9 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  37.1 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  37.1 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  38.21 
 
 		 126 aa  106  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  37.01 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  42.61 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  35.48 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  36.8 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  41.74 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  39.34 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  36.8 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  40.8 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  35.2 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  37.3 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  35.2 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  38.89 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  38.4 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  33.6 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  35.2 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  36.07 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  38.52 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  40.8 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  38.89 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  36.97 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  37.6 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  39.2 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  36 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  39.02 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  35 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  37.4 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  36 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  37.4 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  31.01 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  37.4 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  37.1 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  38.66 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  34.68 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  37.07 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  37.9 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  35.9 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  31.2 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  34.92 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  39.13 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  34.68 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  38.14 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  31.71 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  36.29 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  37.4 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  33.62 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  39.68 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  35.94 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  36.51 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  34.13 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  36.29 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  34.13 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  33.6 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  38.14 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  36 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  33.33 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  35.88 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  35.25 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  32.26 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>