More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2225 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  69.91 
 
 		 452 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  100 
 
 		 451 aa  903    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.47 
 
 		 452 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  67.04 
 
 		 449 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  69 
 
 		 463 aa  611  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  67.13 
 
 		 453 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  68.81 
 
 		 453 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  68.35 
 
 		 453 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  63.02 
 
 		 492 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  62.96 
 
 		 443 aa  552  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  60.47 
 
 		 518 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.47 
 
 		 447 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  61.5 
 
 		 512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  60.82 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  60.19 
 
 		 448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  60.52 
 
 		 454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  60.52 
 
 		 454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  59.67 
 
 		 493 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.6 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  57.82 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 469 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  58.74 
 
 		 446 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  58.66 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  56.29 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  58.14 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  58.37 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  58.14 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  58.37 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  58.37 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  58.37 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  57.67 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  57.44 
 
 		 453 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  58.14 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  58.37 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  58.14 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  56.88 
 
 		 455 aa  494  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  56.64 
 
 		 455 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  56.64 
 
 		 455 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  57.67 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  56.98 
 
 		 443 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  57.01 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  54.53 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.79 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  55.12 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  56.81 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  55.12 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  56.81 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  59.3 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.79 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  54.69 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.44 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  56 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  54.9 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  55.96 
 
 		 457 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  54.57 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.77 
 
 		 450 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  54.76 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  54.42 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  53.94 
 
 		 444 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.01 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  55.12 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.87 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.46 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  54.55 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  53.6 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  54.32 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  52.73 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  55.06 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  54.82 
 
 		 453 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  54.82 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  54.82 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  55.1 
 
 		 459 aa  458  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.36 
 
 		 450 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  54.25 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  54.08 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  54.25 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  54.65 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.5 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  53.64 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  53.85 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  53.62 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  54.8 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  54.47 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3402  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.99 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  54.8 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  54.8 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  54.61 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  54.61 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  54.8 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  54.8 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  54.61 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  54.33 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  52.22 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.12 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  54.48 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  51.81 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  53.07 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  53.13 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  53.46 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.5 
 
 		 458 aa  448  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>