More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0039 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  100 
 
 
588 aa  1160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  46.34 
 
 
602 aa  493  1e-138  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.89 
 
 
592 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  42.93 
 
 
625 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
603 aa  467  1e-130  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  41.97 
 
 
602 aa  460  1e-128  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  42.11 
 
 
616 aa  446  1e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
594 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  43.66 
 
 
621 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  41.05 
 
 
600 aa  416  1e-115  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  36.57 
 
 
614 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  36.21 
 
 
600 aa  407  1e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.1 
 
 
592 aa  400  1e-110  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  37.36 
 
 
622 aa  402  1e-110  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  36.21 
 
 
611 aa  395  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  35.76 
 
 
613 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  36.59 
 
 
619 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  37.63 
 
 
611 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  39.03 
 
 
603 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  2.45046e-06  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  36.74 
 
 
603 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  38.29 
 
 
610 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.54 
 
 
611 aa  383  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.1667e-08  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.78 
 
 
590 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  35.95 
 
 
608 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
586 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.99 
 
 
591 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  33.79 
 
 
588 aa  363  4e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  35.15 
 
 
594 aa  363  5e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  35.06 
 
 
578 aa  362  8e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  37.42 
 
 
607 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  32.93 
 
 
588 aa  360  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 
587 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  33.68 
 
 
587 aa  357  3e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.04 
 
 
587 aa  357  3e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
642 aa  357  4e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  37.86 
 
 
579 aa  356  6e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  37.86 
 
 
579 aa  356  6e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.84481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
592 aa  356  6e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
587 aa  356  7e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.47455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.68 
 
 
587 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.68 
 
 
587 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06018e-05 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  33.68 
 
 
587 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
587 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.42 
 
 
635 aa  355  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.98 
 
 
587 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.42 
 
 
587 aa  353  6e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  33.51 
 
 
587 aa  353  6e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  37.46 
 
 
608 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.8 
 
 
617 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.8 
 
 
602 aa  349  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  33.98 
 
 
587 aa  349  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.96 
 
 
597 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  31.89 
 
 
588 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.01252e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  35.23 
 
 
610 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  32.11 
 
 
589 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  34.37 
 
 
599 aa  345  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  35.23 
 
 
610 aa  344  3e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  33.39 
 
 
610 aa  344  3e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.01 
 
 
598 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  37.2 
 
 
598 aa  343  7e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 
675 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  37.63 
 
 
600 aa  340  6e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.87 
 
 
581 aa  337  5e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  37.35 
 
 
622 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  35.28 
 
 
645 aa  336  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.88 
 
 
609 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
600 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.62 
 
 
592 aa  333  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.1 
 
 
579 aa  333  7e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
636 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
620 aa  330  5e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  31.59 
 
 
586 aa  330  6e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  35.34 
 
 
626 aa  329  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.22 
 
 
597 aa  329  9e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  37.26 
 
 
592 aa  329  9e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.22 
 
 
597 aa  329  1e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  34.39 
 
 
585 aa  328  2e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  31.79 
 
 
594 aa  326  8e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  34.87 
 
 
626 aa  324  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.45 
 
 
617 aa  321  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.00526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  33.45 
 
 
620 aa  320  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  34.39 
 
 
650 aa  320  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  34.19 
 
 
623 aa  319  8e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  32.87 
 
 
576 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.27 
 
 
578 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.27 
 
 
578 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  34.52 
 
 
598 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  34.1 
 
 
598 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  34.26 
 
 
606 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.25 
 
 
666 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.06 
 
 
666 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  35.61 
 
 
629 aa  317  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 
666 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  39.8 
 
 
592 aa  316  8e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.23 
 
 
614 aa  316  9e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.86 
 
 
666 aa  315  1e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.25 
 
 
666 aa  315  1e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.86 
 
 
666 aa  315  1e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.86 
 
 
578 aa  315  2e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  35.86 
 
 
599 aa  314  3e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>