79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1432 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  100 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  64.85 
 
 		 173 aa  237  4e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  50.3 
 
 		 175 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  49.7 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  45.51 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  37.58 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  40.7 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  38.46 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  36.14 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  34.57 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.92 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  34.57 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  35.09 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  35.67 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  34.5 
 
 		 171 aa  97.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  35.76 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  33.92 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  36.55 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  30.86 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.14 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.71 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.06 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.52 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.48 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  24.07 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.34 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  29.76 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.12 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  29.38 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  28.07 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.86 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  29.08 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.43 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  30.28 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.85 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  33.33 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.23 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  27.22 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  26.82 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  29.63 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.82 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.28 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  26.54 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  30 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.34 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.5 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  26 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.86 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.5 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.78 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.22 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.93 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.26 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.22 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  30.86 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  31.91 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.06 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  27.7 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  26.79 
 
 		 163 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.29 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  28.37 
 
 		 153 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  24.68 
 
 		 181 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.17 
 
 		 163 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.81 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  31.21 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  26.47 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.62 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.02 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.38 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.59 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.29 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  28.37 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  26.62 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80500  protein involved in endosome to golgi protein transport  33.33 
 
 		 249 aa  40.4  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>