217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0141 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  94.21 
 
 		 484 aa  940    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  91.94 
 
 		 484 aa  908    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  984    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  94.83 
 
 		 498 aa  944    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  69.38 
 
 		 484 aa  688    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  66.25 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  63.22 
 
 		 482 aa  626  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  63.85 
 
 		 460 aa  605  9.999999999999999e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  59.88 
 
 		 484 aa  568  1e-161  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  54.37 
 
 		 480 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  54.17 
 
 		 480 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  54.79 
 
 		 480 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  54.81 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  54.37 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  53.12 
 
 		 486 aa  528  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  50.93 
 
 		 480 aa  529  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  53.54 
 
 		 486 aa  525  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  53.94 
 
 		 486 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  53.54 
 
 		 486 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  53.12 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  53.44 
 
 		 473 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  51.77 
 
 		 474 aa  502  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  50.73 
 
 		 488 aa  501  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  51.77 
 
 		 474 aa  501  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  50.93 
 
 		 485 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  50.52 
 
 		 486 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  50.21 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  50.72 
 
 		 485 aa  481  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  51.35 
 
 		 493 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  50.31 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  48.97 
 
 		 485 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  51.14 
 
 		 485 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  49.9 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  50.72 
 
 		 476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.17 
 
 		 481 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  51.67 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  49.9 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  46.39 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  48.8 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  48.43 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  49.9 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  50 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  49.49 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  47.52 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  50.21 
 
 		 477 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  49.48 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  52.2 
 
 		 963 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  47.73 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  46.82 
 
 		 475 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  46.18 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  49.06 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  50.31 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  49.69 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  46.8 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  47.42 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  48.04 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  48.2 
 
 		 477 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  49.9 
 
 		 487 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  45.53 
 
 		 476 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  54.78 
 
 		 988 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  47.84 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  48.06 
 
 		 443 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  44.91 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  46.46 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  48.05 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  50 
 
 		 432 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  45.77 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  47.42 
 
 		 484 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  48.16 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  47.08 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  48.7 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  49.35 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  46.04 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  47.52 
 
 		 475 aa  348  9e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  40.78 
 
 		 462 aa  335  9e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  41.36 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  34.05 
 
 		 451 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  32.43 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  31.96 
 
 		 396 aa  176  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  32.34 
 
 		 511 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  30.19 
 
 		 408 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  32.08 
 
 		 514 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  29.76 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.98 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  31.46 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.76 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  29.55 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  29.55 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  29.74 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  29.55 
 
 		 408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  29.55 
 
 		 408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  30.7 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.3 
 
 		 408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  29.21 
 
 		 408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  33.56 
 
 		 466 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.9 
 
 		 404 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  33.26 
 
 		 466 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  29.89 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  30.89 
 
 		 398 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  29.89 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>