More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4122 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4122  PfkB  100 
 
 		 320 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  44.3 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  43.99 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  47.78 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  47.78 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  47.78 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  44.84 
 
 		 313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  44.84 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  41.8 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  41.16 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  36.19 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 319 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  31.96 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  33.75 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  32.46 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.35 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  32.29 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  34.38 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  35.33 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.01 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  32.92 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  33.96 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  33.65 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  34.4 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  33.8 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  32.5 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.64 
 
 		 312 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.88 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  30.63 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  30.56 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  30.63 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  29.69 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.6 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.01 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  32.83 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  34.28 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  32.86 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  33.22 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  29.91 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl514  fructokinase  31.73 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.27 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  32.7 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.88 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  31.87 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  32.72 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  32.51 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.63 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  31.64 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  31.64 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.84 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.16 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  29.52 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.74 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  30.75 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.16 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  31.21 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  29.96 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  30.59 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  29.84 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  33.47 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.43 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  31.99 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.41 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  29.07 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  29.84 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  29.6 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.94 
 
 		 333 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  29.1 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  29.94 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  28.92 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  28.88 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  30.4 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.2 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  29.54 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  29.54 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  30.12 
 
 		 323 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  31 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  28.35 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  29.39 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>