More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2421 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  76.75 
 
 		 443 aa  690    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 443 aa  872    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.1 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.11 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.24 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  46.79 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  46.33 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  47.25 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.17 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.98 
 
 		 449 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  47 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.88 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.11 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.22 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.96 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  46.08 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.17 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  46.17 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.19 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.88 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.96 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  46.4 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.65 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.96 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  45.96 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.19 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.6 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.67 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.71 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.01 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  46.19 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.27 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.62 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.31 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.85 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.87 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  45.96 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.5 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.24 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3583  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.01 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  45.14 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.8 
 
 		 446 aa  359  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.93 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.83 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.27 
 
 		 430 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.3 
 
 		 430 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.37 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.71 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  46.63 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  46.88 
 
 		 494 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.37 
 
 		 433 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.71 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.91 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.3 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  45.16 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.68 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.7 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  45.03 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.58 
 
 		 454 aa  345  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  43.61 
 
 		 433 aa  343  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.59 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.11 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.59 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.35 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.8 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3208  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.74 
 
 		 436 aa  342  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  41.84 
 
 		 442 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  41.84 
 
 		 442 aa  342  9e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.84 
 
 		 442 aa  342  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.82 
 
 		 433 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.45 
 
 		 453 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.2 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  42.36 
 
 		 433 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.12 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.36 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.59 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.1 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  43.25 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  45.21 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  41.56 
 
 		 465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  43.78 
 
 		 453 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  41.78 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  41.53 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.22 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  44.75 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1753  xanthine/uracil permease family protein  42.05 
 
 		 482 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  39.82 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  39.82 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  39.82 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  39.82 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>