More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5452 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  95.26 
 
 
229 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  72.99 
 
 
232 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  45.75 
 
 
227 aa  194  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  44.39 
 
 
236 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  38.51 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  32.84 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  33.47 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59029  predicted protein  35.05 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318657  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  31.86 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09497  HAD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10760)  35.47 
 
 
296 aa  108  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1319  HAD family hydrolase  42.42 
 
 
219 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  37 
 
 
217 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04170  conserved hypothetical protein  37.87 
 
 
251 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.28 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
396 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.35 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.6 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  34.02 
 
 
222 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 
222 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  37.76 
 
 
225 aa  91.7  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.29 
 
 
238 aa  91.3  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.87 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.54 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15581  phosphatase/phosphohexomutase  31.82 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  36.51 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  39.6 
 
 
212 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  36.26 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.2 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29210  predicted protein  35.61 
 
 
289 aa  86.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1138  HAD family hydrolase  34.13 
 
 
216 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.98 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.94 
 
 
249 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.55 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  33.98 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37770  putative hydrolase  36.87 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00140245  normal  0.135547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.59 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.85 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  34.47 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  33.85 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  36.07 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.85 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  33.85 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  30.69 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  33.85 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  33.85 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  34.36 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  34.21 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  35.16 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  34.13 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.7 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  36.71 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.4 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.59 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  32.85 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  34.18 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  30.15 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.52 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  35.08 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  35.48 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.98 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.46 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  35.08 
 
 
762 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  28.72 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  34.55 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  34.55 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  34.55 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  25.48 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.95 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  29.17 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  34.55 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.11 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  28.99 
 
 
454 aa  77  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  33.99 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.51 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  28.92 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  36.15 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.44 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  34.36 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  37.8 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.63 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  36.76 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>