More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59029 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_59029  predicted protein  100 
 
 
236 aa  485  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318657  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09497  HAD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10760)  43.95 
 
 
296 aa  184  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  37.31 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  37.81 
 
 
229 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  31.7 
 
 
227 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  32.74 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  35.05 
 
 
212 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04170  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 
251 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  31.4 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  27.39 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  29.8 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.15 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.67 
 
 
219 aa  79  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.8 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  29.72 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  26.07 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.11 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  31.84 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.85 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  27.64 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  27.49 
 
 
728 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.36 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  29.57 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  26.53 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  30.23 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  27.85 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  27.96 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  28.05 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.86 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  27.55 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  29.06 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.18 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.22 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.73 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  27.01 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  28.64 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  28.36 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.29 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.35 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  27.4 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  28.14 
 
 
188 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  25.6 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  25.85 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  28.15 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  25.66 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.58 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.67 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1843  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.64 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101722  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  29.41 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.8 
 
 
188 aa  62  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15581  phosphatase/phosphohexomutase  26.72 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  28.26 
 
 
232 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.05 
 
 
217 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  28.5 
 
 
218 aa  62  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  27.83 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  27.57 
 
 
714 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.56 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.04 
 
 
396 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.49 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  25.73 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  26.8 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  27.19 
 
 
707 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  28 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  27.91 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  26.8 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  27.1 
 
 
710 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  26.8 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  26.8 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  27.5 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.06 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.83 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  27.36 
 
 
188 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
707 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.21 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  26.72 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.07 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  24.14 
 
 
454 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.94 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  27.84 
 
 
188 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  27.84 
 
 
188 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>