60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2521 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  94.68 
 
 		 96 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  73.68 
 
 		 96 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  63.95 
 
 		 101 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  60.92 
 
 		 101 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  54.26 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  56.04 
 
 		 97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  58.33 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  54.65 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  58.33 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  57.95 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  55.06 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  54.55 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  54.55 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  53.57 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  55.95 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  48.35 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  52.38 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  51.09 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  52.38 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  47.19 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  46.59 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  47.67 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  47.62 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  37.97 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.78 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  41.77 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  40.96 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  30.53 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.1 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  33.7 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  36.9 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.85 
 
 		 987 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  31.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  27.5 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  35.14 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  27.5 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  27.5 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  36.14 
 
 		 965 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  29.27 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  28 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  22.5 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  34.15 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  32.5 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  28 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.62 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  31.58 
 
 		 98 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.33 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.78 
 
 		 591 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  29.9 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  39.62 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  32.91 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 983 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>