More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5977 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  100 
 
 		 325 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  97.23 
 
 		 325 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  82.52 
 
 		 326 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  80.31 
 
 		 325 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  80.62 
 
 		 325 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  79.63 
 
 		 328 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  79.69 
 
 		 325 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  79.81 
 
 		 325 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  79.69 
 
 		 325 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  78.46 
 
 		 325 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  63.27 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  60.99 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.87 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.8 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.68 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.68 
 
 		 324 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  57.58 
 
 		 334 aa  364  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.94 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.11 
 
 		 324 aa  355  6.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  59.94 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  54.35 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.88 
 
 		 324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  56.21 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  54.04 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.93 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  56.21 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.04 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  53.11 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  52.32 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.38 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.94 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.48 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.54 
 
 		 326 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.78 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  53.11 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.35 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  53.21 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  54.04 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 		 324 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  49.23 
 
 		 324 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.66 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 		 333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  54.04 
 
 		 324 aa  301  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 		 324 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  53.64 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.15 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  52.92 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  47.99 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  52.8 
 
 		 326 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  49.02 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 		 340 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.6 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.17 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  46.39 
 
 		 324 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  44.52 
 
 		 323 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  47.69 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.46 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  45.65 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.65 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  45.48 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  45.21 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.11 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.91 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.79 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  43.33 
 
 		 324 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.69 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.56 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.64 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.92 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  42.9 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.76 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.46 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  40.18 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>