290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0273 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  603  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  96.66 
 
 		 299 aa  583  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  34.49 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  33.33 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  36.9 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  34.02 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  35.12 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  34.32 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  34.29 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  35.86 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.22 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  33.77 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  35.59 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  33.97 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  33.77 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  36.95 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.27 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  32.14 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  32.7 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  31.6 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  33.21 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  31.21 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  31.21 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  33.81 
 
 		 306 aa  148  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  32.76 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  35.27 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  32.18 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  33.68 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  31.88 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  35.62 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  33.69 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  32.25 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  32.63 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  32.25 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  32.99 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  35.27 
 
 		 315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  30.45 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  35.27 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  32.14 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  31.83 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  31.25 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  31.58 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  32.98 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.11 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.48 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  31.72 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  30.77 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  31.56 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  28.97 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  30.77 
 
 		 327 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  30.77 
 
 		 327 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30 
 
 		 305 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.45 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21330  Taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  32.37 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545392  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  32.86 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  29.66 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  31.42 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  30.77 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  33.68 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.94 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  31.85 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  30.28 
 
 		 282 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  31.93 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  31.71 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  32.16 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  33.45 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.78 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  28.72 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  30.77 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  31.93 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  31.14 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  29.94 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  32.16 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  29.57 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  32.49 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  27.12 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  28.47 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  32.51 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  32.13 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1415  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.62 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  29.11 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  30.58 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  30.07 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  30.58 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  30.58 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  30.45 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  29.41 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  30.58 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  31.03 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  30.58 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  31.06 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  31.1 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  30.07 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  30.64 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  30.07 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  29.93 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>