39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70210 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  100 
 
 		 444 aa  911    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  65.69 
 
 		 450 aa  619  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  47.1 
 
 		 748 aa  411  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  32.97 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  33.19 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  31.88 
 
 		 934 aa  227  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  31.9 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  30.39 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  30.28 
 
 		 682 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  37.17 
 
 		 380 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  33.47 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1047  saccharopine dehydrogenase  35.71 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.0319495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  28.98 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  24.73 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  23.18 
 
 		 384 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  25.3 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  27.38 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  25.76 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  24.44 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  24.24 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  24.81 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  24.73 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  24.73 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  21.94 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  21.94 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  23.83 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  26.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  22.46 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  27.14 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  27.78 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  21.55 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  23.28 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  24.12 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  24.12 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  22.07 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  20.94 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  25.31 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  24.76 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  25.93 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>