More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56924 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  682    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  47.87 
 
 
328 aa  315  6e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  48.65 
 
 
331 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  41.95 
 
 
328 aa  259  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 
325 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.72 
 
 
319 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  35.57 
 
 
340 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.77 
 
 
347 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
351 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 
351 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.48 
 
 
341 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.48 
 
 
341 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  35.06 
 
 
322 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
335 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
341 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.66 
 
 
348 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.46 
 
 
347 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  34.87 
 
 
332 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  30.43 
 
 
334 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  31.77 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
348 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  31.53 
 
 
337 aa  125  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  30.32 
 
 
354 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  32.03 
 
 
335 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  30.77 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  30.59 
 
 
334 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
352 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  28.86 
 
 
346 aa  119  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  29.6 
 
 
336 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  29.79 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  30.93 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  31.01 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  28.43 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  29.77 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  29.77 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  30.59 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
355 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  29.39 
 
 
357 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
357 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  31.38 
 
 
335 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  30.74 
 
 
334 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  28.39 
 
 
336 aa  103  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  26.37 
 
 
341 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  29.8 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.8 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  26.03 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2077  hypothetical protein  41.35 
 
 
155 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398465  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  30.85 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  30.35 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  27.16 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  28.64 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  29.35 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  28.95 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  26.13 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  24.73 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  27.78 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.53 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.62 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.62 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.43 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.43 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.43 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.23 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  32.46 
 
 
342 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  25.61 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  27.04 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.21 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>