59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33462 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  100 
 
 
684 aa  1394    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  31.66 
 
 
420 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  36.08 
 
 
834 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  28.03 
 
 
492 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  27.03 
 
 
500 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  27.88 
 
 
493 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  27.03 
 
 
505 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  27.59 
 
 
499 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  28.01 
 
 
504 aa  110  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  26.79 
 
 
501 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  26.79 
 
 
501 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  27.72 
 
 
381 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  25.97 
 
 
494 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  25.97 
 
 
494 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  25.75 
 
 
383 aa  90.9  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  27.25 
 
 
503 aa  87.8  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  27.38 
 
 
493 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  28.69 
 
 
550 aa  87.4  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  28.09 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  33.01 
 
 
499 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  33.15 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  30.04 
 
 
392 aa  84  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  26.51 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  29.84 
 
 
364 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  30.46 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  29.41 
 
 
493 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  28.23 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  27.67 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  28.33 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  24.73 
 
 
388 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  27.83 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  25.1 
 
 
378 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  29.53 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  28.64 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  28.26 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  28.72 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  26.97 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  25.7 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  27.4 
 
 
330 aa  65.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  25.11 
 
 
368 aa  65.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  27.33 
 
 
342 aa  63.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  24.51 
 
 
423 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  26.47 
 
 
342 aa  53.9  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  25.65 
 
 
379 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  25.88 
 
 
422 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  25.37 
 
 
239 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  28.27 
 
 
341 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  24.32 
 
 
241 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  24.12 
 
 
378 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  27.07 
 
 
241 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  27.07 
 
 
241 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  26.56 
 
 
247 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  27.36 
 
 
377 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  27.07 
 
 
241 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  27.07 
 
 
241 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  24.49 
 
 
373 aa  46.6  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  23.94 
 
 
364 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  25.56 
 
 
241 aa  44.3  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  25.56 
 
 
241 aa  44.3  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>