61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4480 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  100 
 
 
315 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  99.05 
 
 
315 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  96.83 
 
 
315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  61.96 
 
 
322 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  43.45 
 
 
364 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  37.2 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  37.11 
 
 
550 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  35.92 
 
 
330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  37.38 
 
 
379 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  40.85 
 
 
493 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  32.73 
 
 
341 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  33.13 
 
 
350 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  37.5 
 
 
491 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  36.92 
 
 
378 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  34.32 
 
 
342 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  35.89 
 
 
494 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  35.89 
 
 
494 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  35.47 
 
 
392 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  36.84 
 
 
381 aa  152  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  36.13 
 
 
378 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  31.35 
 
 
342 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  33.54 
 
 
369 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  42.86 
 
 
491 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  35.37 
 
 
388 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  38.53 
 
 
503 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  42.53 
 
 
397 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  41.6 
 
 
326 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  32.72 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  34.87 
 
 
493 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  38.22 
 
 
499 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  31.6 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  27.61 
 
 
422 aa  125  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  36.69 
 
 
388 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  36.76 
 
 
399 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  32.25 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  31.99 
 
 
492 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  32.67 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  33.44 
 
 
493 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  31.19 
 
 
505 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  31.29 
 
 
499 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  30.41 
 
 
501 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  30.41 
 
 
501 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  27.99 
 
 
500 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  29.01 
 
 
504 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  28.09 
 
 
420 aa  77  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  28.33 
 
 
684 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  25.45 
 
 
834 aa  62.8  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  36.96 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  33.33 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  39.44 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  39.44 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  37.89 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  39.44 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  39.44 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  39.44 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  38.03 
 
 
241 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  30.3 
 
 
239 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  35.37 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  36.23 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  35.06 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  32.5 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>