55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1182 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  100 
 
 
326 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  38.36 
 
 
364 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  35.95 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  40.07 
 
 
322 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  33.97 
 
 
550 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  40.08 
 
 
503 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  35.54 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  39.19 
 
 
494 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  39.19 
 
 
494 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  33.22 
 
 
369 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  41.98 
 
 
315 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  39.84 
 
 
493 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  41.6 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  43.04 
 
 
493 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  40.84 
 
 
315 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  33.45 
 
 
392 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  37.36 
 
 
491 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  36.4 
 
 
378 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  37.15 
 
 
388 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  43.98 
 
 
491 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  33.01 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  41.04 
 
 
499 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  35.17 
 
 
383 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  37.84 
 
 
492 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  35.02 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  34.19 
 
 
317 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  31.71 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  31.75 
 
 
499 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  29.51 
 
 
342 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  31.75 
 
 
378 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  30.9 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  35.02 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  31.76 
 
 
342 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  33.2 
 
 
368 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  35.06 
 
 
501 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  35.06 
 
 
501 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  34.76 
 
 
505 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  33.33 
 
 
500 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  37.75 
 
 
397 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  30.18 
 
 
341 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  32.87 
 
 
423 aa  99.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  29.67 
 
 
504 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  35.64 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  53.33 
 
 
422 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  27.05 
 
 
420 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  29.61 
 
 
684 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  23.02 
 
 
834 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  22.04 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  29.05 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  27.56 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  32.89 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  29.48 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  28.32 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  28 
 
 
241 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  28 
 
 
241 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>