57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2710 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  100 
 
 
388 aa  775    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  59.26 
 
 
399 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  45.33 
 
 
422 aa  292  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  36.88 
 
 
342 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  37.07 
 
 
330 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  36.22 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  37.25 
 
 
397 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  36.53 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  46.47 
 
 
342 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  30.68 
 
 
317 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  38.11 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  36.69 
 
 
315 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  36.69 
 
 
315 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  36.29 
 
 
315 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  33.87 
 
 
378 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  34.01 
 
 
503 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  36.11 
 
 
550 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  35.53 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  35.81 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  35.02 
 
 
494 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  33.08 
 
 
369 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  35.02 
 
 
494 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  35.2 
 
 
364 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  31.48 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  35.71 
 
 
326 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  33.82 
 
 
491 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  34.03 
 
 
493 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  36.27 
 
 
493 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  35.23 
 
 
491 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  32.76 
 
 
369 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  33.17 
 
 
499 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  35.32 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  32.22 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  35.11 
 
 
368 aa  90.1  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  33.62 
 
 
379 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  31.47 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  28.79 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  27.72 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  31.52 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  28.86 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  27.69 
 
 
500 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  27.01 
 
 
501 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  27.01 
 
 
501 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  27.65 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  24.73 
 
 
684 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  25.78 
 
 
504 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  25 
 
 
834 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  34.74 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  30.85 
 
 
337 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  32.89 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  27.18 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  32.89 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  32.89 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  32.89 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  32.89 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  32.89 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  28.16 
 
 
241 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>