46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44486 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  100 
 
 
834 aa  1700    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  36.08 
 
 
684 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  31.3 
 
 
492 aa  104  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  28.8 
 
 
493 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  29.54 
 
 
500 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  28.4 
 
 
493 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  29.06 
 
 
504 aa  97.8  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  27.82 
 
 
420 aa  97.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  28.81 
 
 
494 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  28.4 
 
 
505 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  28.81 
 
 
494 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  29.46 
 
 
491 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  30.08 
 
 
493 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  27.27 
 
 
499 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  26.8 
 
 
369 aa  87.8  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  26.8 
 
 
501 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  26.8 
 
 
501 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  28.57 
 
 
503 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  29.15 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  26.8 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  27.73 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  25.3 
 
 
550 aa  77.8  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  26.35 
 
 
383 aa  73.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  26.38 
 
 
364 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  25.53 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  27.92 
 
 
397 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  26.2 
 
 
399 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  25.45 
 
 
315 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  27 
 
 
322 aa  60.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  25.09 
 
 
315 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  24.02 
 
 
388 aa  59.3  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  25.14 
 
 
326 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  26.16 
 
 
315 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  25.73 
 
 
368 aa  56.6  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  26.88 
 
 
392 aa  56.6  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  25.13 
 
 
350 aa  55.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  23.75 
 
 
379 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  26.13 
 
 
342 aa  55.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  25 
 
 
388 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  26.8 
 
 
317 aa  53.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  27.44 
 
 
330 aa  52.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  32.93 
 
 
422 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  22.6 
 
 
378 aa  48.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  22.3 
 
 
378 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  25.26 
 
 
341 aa  46.2  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  22.22 
 
 
423 aa  44.3  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>