60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0908 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  100 
 
 
422 aa  851    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  45.31 
 
 
388 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  39.82 
 
 
399 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  36.36 
 
 
397 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  33.49 
 
 
342 aa  206  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  32.69 
 
 
350 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  35.04 
 
 
330 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  32.69 
 
 
341 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  33.57 
 
 
342 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  29.11 
 
 
317 aa  149  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  28.4 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  28.4 
 
 
315 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  28.15 
 
 
315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  32.41 
 
 
322 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  31.33 
 
 
503 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  32.57 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  29.57 
 
 
381 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  31.27 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  32.39 
 
 
493 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  30.45 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  41.61 
 
 
494 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  41.61 
 
 
494 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  41.91 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  51.11 
 
 
491 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  43.06 
 
 
326 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  46.67 
 
 
491 aa  89.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  38.52 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  39.69 
 
 
388 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  41.67 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  39.84 
 
 
550 aa  86.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  43.81 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  36.64 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  38.41 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  40.31 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  40.22 
 
 
499 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  32.5 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  38.02 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  30.07 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  30.77 
 
 
505 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  29.82 
 
 
501 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  29.82 
 
 
501 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  34.18 
 
 
493 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  29.66 
 
 
500 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  31.13 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  35 
 
 
239 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  36 
 
 
241 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  33.33 
 
 
241 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  33.33 
 
 
241 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  33.33 
 
 
241 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  33.33 
 
 
241 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  35.37 
 
 
247 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  29.57 
 
 
504 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  33.33 
 
 
241 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  25.88 
 
 
684 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  33.33 
 
 
241 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  33.33 
 
 
337 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  32.93 
 
 
834 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  33.73 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  29.59 
 
 
305 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  32.58 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>