58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3682 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  100 
 
 
378 aa  737    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  90.93 
 
 
379 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  38.97 
 
 
364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  42.47 
 
 
322 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  39.38 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  39.08 
 
 
315 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  34.34 
 
 
550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  38.77 
 
 
315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  34.76 
 
 
369 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  37.01 
 
 
392 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  38.46 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  35.93 
 
 
378 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  36.82 
 
 
503 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  30.2 
 
 
369 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  29.76 
 
 
494 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  29.76 
 
 
494 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  31.36 
 
 
381 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  33.33 
 
 
326 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  31.09 
 
 
491 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  30.99 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  34.51 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  38.14 
 
 
493 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  28.23 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  32.23 
 
 
341 aa  126  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  32.01 
 
 
383 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  32.31 
 
 
330 aa  123  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  33.19 
 
 
499 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  34.15 
 
 
317 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  32.91 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  31.03 
 
 
342 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  38.1 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  35.5 
 
 
491 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  35.32 
 
 
388 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  32.19 
 
 
423 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  27.73 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  33.17 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  27.25 
 
 
500 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  25.83 
 
 
493 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  27.15 
 
 
501 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  27.15 
 
 
501 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  41.38 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  25.37 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  27.17 
 
 
499 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  24.91 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  22.3 
 
 
834 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  26.47 
 
 
504 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  24.57 
 
 
684 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  38.38 
 
 
241 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  34.62 
 
 
239 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  35.37 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  35.37 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  25.71 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  24.7 
 
 
241 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  24.7 
 
 
241 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  24.7 
 
 
241 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  26.4 
 
 
293 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  34.15 
 
 
241 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  32.63 
 
 
247 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>