71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0719 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  100 
 
 
369 aa  748    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  53.46 
 
 
369 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  40.71 
 
 
381 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  42.66 
 
 
388 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  42.98 
 
 
392 aa  258  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  40.83 
 
 
378 aa  256  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  37.43 
 
 
383 aa  225  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  36.8 
 
 
550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  37.68 
 
 
494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  37.68 
 
 
494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  39.38 
 
 
493 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  38.89 
 
 
491 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  38.31 
 
 
503 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  38.31 
 
 
364 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  41.74 
 
 
493 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  36.05 
 
 
326 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  34.48 
 
 
315 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  37.55 
 
 
491 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  35.78 
 
 
322 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  33.86 
 
 
315 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  33.54 
 
 
315 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  33.53 
 
 
342 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  30.61 
 
 
341 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  39.47 
 
 
499 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  30.61 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  30.29 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  33.55 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  34.17 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  29.28 
 
 
505 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  31.31 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  29.18 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  29.33 
 
 
492 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  30.09 
 
 
500 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  29.07 
 
 
368 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  31.39 
 
 
499 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  30.38 
 
 
501 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  30.38 
 
 
501 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  36.08 
 
 
397 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  28.72 
 
 
493 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  32.56 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  34.67 
 
 
399 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  32.76 
 
 
388 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  27.19 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  38.41 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  28.09 
 
 
684 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  38.89 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  27.04 
 
 
834 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  28.73 
 
 
313 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  30.19 
 
 
305 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  28.21 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  25.64 
 
 
241 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  32.69 
 
 
370 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  25.64 
 
 
241 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  25.64 
 
 
241 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  25 
 
 
241 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  28.21 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  28.21 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  25.77 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  22.47 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  23.85 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  37.18 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  27.91 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  35.9 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  26.82 
 
 
375 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  36 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  36 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  31.71 
 
 
360 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  36 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  36 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  36 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  35.9 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>