More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54983 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  100 
 
 
891 aa  1858    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  45.19 
 
 
866 aa  723    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  37.51 
 
 
873 aa  515  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  35.75 
 
 
1016 aa  478  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3554  predicted protein  46.75 
 
 
375 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298587  normal  0.425378 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  36.53 
 
 
380 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.17 
 
 
361 aa  184  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.56 
 
 
359 aa  184  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  39.1 
 
 
510 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  33.59 
 
 
367 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6009  predicted protein  39.45 
 
 
255 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00336907  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68997  NADH-cytochrome b-5 reductase  38.76 
 
 
284 aa  178  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  31.53 
 
 
600 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  32.8 
 
 
363 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  36.14 
 
 
458 aa  165  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487731 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16490  predicted protein  34.57 
 
 
281 aa  158  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0436831  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06366  NADH-cytochrome b5 reductase 1 (EC 1.6.2.2)(Microsomal cytochrome b reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZB4]  35.77 
 
 
310 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0688408  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38305  predicted protein  32.66 
 
 
285 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151524  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00240  NADH-cytochrome b5 reductase, putative  33.7 
 
 
294 aa  147  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30 
 
 
407 aa  144  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45522  NADH-cytochrome b-5 reductase  32.4 
 
 
296 aa  140  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.443636  normal  0.123959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.08 
 
 
369 aa  140  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  28.77 
 
 
369 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.43 
 
 
453 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  29.89 
 
 
372 aa  128  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  29.56 
 
 
369 aa  125  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.15 
 
 
409 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44816  NADH-cytochrome b-5 reductase  30.8 
 
 
298 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.22 
 
 
369 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  29.28 
 
 
431 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  30.71 
 
 
370 aa  119  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.99 
 
 
415 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00432  NADH-cytochrome b5 reductase 2 (EC 1.6.2.2)(Mitochondrial cytochrome b reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BG98]  29.81 
 
 
322 aa  118  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.032359  normal  0.180779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  26.17 
 
 
451 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  27.99 
 
 
420 aa  114  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  27.31 
 
 
410 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  29.38 
 
 
431 aa  110  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  29.66 
 
 
406 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  28.9 
 
 
428 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  28.9 
 
 
428 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  27.91 
 
 
414 aa  108  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  28.81 
 
 
424 aa  108  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.94 
 
 
418 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.94 
 
 
418 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.1 
 
 
425 aa  107  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.34 
 
 
416 aa  106  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  28.45 
 
 
419 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 
425 aa  106  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  30.13 
 
 
418 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.1 
 
 
501 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29660  predicted protein  32.22 
 
 
260 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  26.58 
 
 
412 aa  105  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  28.02 
 
 
427 aa  105  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  28.46 
 
 
402 aa  105  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  28.74 
 
 
448 aa  104  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  27 
 
 
414 aa  104  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.9 
 
 
400 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01240  cytochrome-b5 reductase, putative  29.49 
 
 
352 aa  103  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  28.31 
 
 
376 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  28.46 
 
 
406 aa  103  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  25.74 
 
 
408 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.53 
 
 
417 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  28.8 
 
 
437 aa  102  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  26.65 
 
 
431 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.94 
 
 
416 aa  101  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.39 
 
 
411 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29658  predicted protein  30.54 
 
 
259 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  27.33 
 
 
409 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
417 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.39 
 
 
400 aa  99.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.32 
 
 
406 aa  99.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  28.46 
 
 
414 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.21 
 
 
408 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  28.25 
 
 
429 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.81 
 
 
414 aa  97.8  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  30.07 
 
 
445 aa  97.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  30.07 
 
 
451 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.1 
 
 
405 aa  97.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  27.69 
 
 
408 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  28.01 
 
 
426 aa  97.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  28.82 
 
 
457 aa  97.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.69 
 
 
408 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.68 
 
 
412 aa  96.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  25.89 
 
 
408 aa  96.3  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
414 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  27.49 
 
 
412 aa  97.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.68 
 
 
412 aa  96.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  29.76 
 
 
427 aa  96.3  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  29.74 
 
 
449 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  29.62 
 
 
443 aa  95.5  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 
402 aa  95.5  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  27.3 
 
 
414 aa  95.1  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  27.94 
 
 
457 aa  95.1  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  26.39 
 
 
425 aa  94.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.99 
 
 
408 aa  94.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  28.57 
 
 
425 aa  94.4  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.41 
 
 
451 aa  93.6  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  24.29 
 
 
457 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  25.56 
 
 
437 aa  93.2  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  28.06 
 
 
440 aa  92.8  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>