92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40588 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_40588  predicted protein  100 
 
 
387 aa  776    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33726  predicted protein  48.35 
 
 
486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47352  predicted protein  29.23 
 
 
501 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26318  DMT family transporter: drug/metabolite  26.22 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32535  predicted protein  26.39 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264951  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45098  predicted protein  27.65 
 
 
647 aa  76.6  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49268  predicted protein  26.74 
 
 
579 aa  73.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  29.36 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32216  DMT family transporter: drug/metabolite  26.81 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681934  normal  0.0531718 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  24.22 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.44 
 
 
293 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.11 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  26.61 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45965  predicted protein  25.8 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  24.18 
 
 
298 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  24.43 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  24.43 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  24.43 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  24.43 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.77 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  23.19 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  24.05 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  24.77 
 
 
277 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 
304 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 
304 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  24.05 
 
 
303 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
296 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  26.7 
 
 
304 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  24.37 
 
 
317 aa  56.2  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  23.36 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  23.08 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  23.89 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  25.1 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  23.89 
 
 
301 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48145  predicted protein  24.85 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  23.28 
 
 
301 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  24.68 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.34 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 
308 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0663  integral membrane protein, putative transmembrane transporter  24.78 
 
 
288 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  24.62 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  28.25 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  29.57 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  24.48 
 
 
299 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  24.2 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  23.57 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  26.1 
 
 
323 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  28.82 
 
 
325 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.14 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  22.54 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  24.81 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  22.43 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.67 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  24.49 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  24.56 
 
 
297 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  23.43 
 
 
301 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  24.02 
 
 
299 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  22.32 
 
 
305 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.54 
 
 
313 aa  46.6  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  23.66 
 
 
279 aa  46.6  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  22.52 
 
 
297 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 
318 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  24.06 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  23.18 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  21.76 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  24.06 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  27.96 
 
 
267 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.07 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  28.91 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  24.39 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18490  DMT family transporter: drug/metabolite  24.19 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00171701  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  21.27 
 
 
288 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  21.67 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  21.69 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1683  hypothetical protein  26.78 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  24.76 
 
 
290 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
293 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  27.15 
 
 
292 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  21.67 
 
 
316 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  23.58 
 
 
307 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.08 
 
 
315 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  22.69 
 
 
295 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.89 
 
 
294 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.36 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  22.58 
 
 
302 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  31.34 
 
 
274 aa  43.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>