More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16963 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_16963  glutaminyl-trna synthetase  100 
 
 		 568 aa  1179    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 561 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 565 aa  595  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 572 aa  595  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 565 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 580 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 568 aa  586  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 565 aa  586  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 566 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 561 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 556 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 570 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 565 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 587 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 567 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 569 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 567 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 556 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 569 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 564 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 567 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 568 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 555 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 563 aa  566  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 569 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 569 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 601 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 565 aa  561  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 596 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 589 aa  565  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 596 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 569 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 569 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 565 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 569 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 579 aa  558  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 560 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 580 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 553 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 561 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 561 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 569 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 559 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 569 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 562 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 551 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 609 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 625 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 612 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 552 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 583 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 552 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 551 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 563 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 554 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 569 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 558 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 569 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3615  glutaminyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 604 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 552 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 569 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 556 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 582 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 559 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 582 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 569 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 556 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 620 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 558 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 564 aa  541  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 552 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 552 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 559 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 590 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 573 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 555 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 555 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 555 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 580 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.352024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 619 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 555 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 554 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 609 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0613  glutaminyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 587 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.794454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 555 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>